De eenzame middelbare scholier, Yukiteru Amano, brengt zijn dagen door met het schrijven van een dagboek op zijn mobiele telefoon, terwijl hij praat met zijn twee ogenschijnlijk denkbeeldige vrienden Deus Ex Machina, de god van tijd en ruimte, en Murmur, de dienaar van de god. Deus onthult zichzelf als een daadwerkelijke entiteit en schenkt Yukiteru een "Random Diary", dat zeer gedetailleerde toekomstige vermeldingen toont en hem dwingt tot een bloederige battle royale met 11 andere houders van vergelijkbaar krachtige toekomstdagboeken.