Beroemde magiër Harry Potter heeft een groot probleem. Lord Voldemort is weer vrijgekomen en terroriseert Zweinstein. Harry is bezig met belangrijke magische taken, dus het spel Harry Potter in Trouble roept om hulp voor de stad, de thuisbasis van zijn geliefde toverschool, andere zwaargewichten. Dit zal niemand minder zijn dan de President van de Verenigde Staten van Amerika, Barack Obama. Er wacht hem echter een werkelijk moeilijke taak. Tijdens dit avontuur zal hij een groot aantal artefacten moeten vinden die gebruikt moeten worden. De sympathieke Amerikaanse president zal zelfs hebben geleerd om een toverstok te gebruiken en enkele basisspreuken uit te voeren die hem goed van pas zullen komen tijdens het spelen.